Setelah perang antarbintang pada awal abad ke-21, Bumi telah hancur lebur, dengan sebagian besar ekosistemnya hancur total. Karena tidak lagi mungkin untuk hidup normal di planet ini, penduduknya terpaksa pindah ke planet lain di mana kehidupan, semoga, akan lebih nyaman.

Organisasi Perdagangan Galaksi Dalam, sebuah pemerintahan totaliter yang mempengaruhi banyak planet yang baru dihuni, entah bagaimana sampai pada kesimpulan bahwa musik adalah sumber kejahatan, dan harus dilarang dan dihancurkan selamanya. Kelompok talenta AKB0048 pun dibentuk, berdasarkan anggota asli AKB48 yang pernah tinggal di Bumi. Meskipun musik mereka kini dianggap ilegal secara universal, mereka menjadikan misi mereka untuk menghidupkan kembali musik mereka dengan berkeliling dari satu planet ke planet lain dan mengadakan sebanyak mungkin konser. Mereka harus menjalani metode pelatihan baru untuk menjadi yang terbaik yang mereka bisa, sambil menghindari bahaya konstan ditangkap karena musik mereka. Bergabunglah dengan bintang pop antarbintang AKB0048 saat mereka berusaha menyelamatkan dunia—dengan musik!

Catatan: Sinopsis diterjemahkan secara otomatis oleh Google Translate.